公司有緩衝5分鐘（不含）不算遲到，可以處理嗎？

可以，請在差勤→基本設定→出勤班別管理：點選欲設定班別進入→點入時段資料(異常判定標準)頁面→點段別1進入且在遲到/曠職定義內設定晚到達5分鐘以上。